Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CACNA1SQ13698 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
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