Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTM1Q13496 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTM1Q13496 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms