Protein–RNA interactions for Protein: Q13183

SLC13A2, Solute carrier family 13 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A2Q13183 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC13A2Q13183 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A2Q13183 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms