Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHAF1AQ13111 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHAF1AQ13111 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHAF1AQ13111 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms