Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRDNQ13061 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRDNQ13061 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
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