Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 EFCAB2-201ENST00000366521 860 ntTSL 212.08□□□□□ -0.483e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.59e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EFCAB2-213ENST00000497591 1201 ntTSL 511.85□□□□□ -0.513e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-208ENST00000558746 874 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.519e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-210ENST00000558893 1209 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.579e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 TBL1X-208ENST00000452824 387 ntTSL 511.39□□□□□ -0.599e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 UBE3C-203ENST00000430750 448 ntTSL 410.94□□□□□ -0.663e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EFCAB2-208ENST00000473686 906 ntTSL 510.54□□□□□ -0.723e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-217ENST00000559690 680 ntTSL 39.41□□□□□ -0.99e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EFCAB2-211ENST00000487845 1389 ntTSL 29.19□□□□□ -0.943e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.963e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EFCAB2-207ENST00000447569 527 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.023e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 FAM222B-201ENST00000341217 4033 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.063e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 THADA-201ENST00000398653 5900 ntTSL 28.35□□□□□ -1.073e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 NSD1-216ENST00000638627 1866 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.083e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 THADA-208ENST00000407351 3678 ntTSL 28.17□□□□□ -1.13e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 THADA-209ENST00000408045 5585 ntTSL 1 (best)8.08□□□□□ -1.123e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-209ENST00000558830 616 ntTSL 37.34□□□□□ -1.239e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.33e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.33e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 36.68□□□□□ -1.349e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 56.68□□□□□ -1.349e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-212ENST00000559158 793 ntTSL 36.49□□□□□ -1.379e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-213ENST00000559244 582 ntTSL 36.35□□□□□ -1.399e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.47e-11■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-221ENST00000560422 761 ntTSL 56.2□□□□□ -1.429e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.423e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.489e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EFCAB2-215ENST00000549220 557 ntTSL 45.78□□□□□ -1.483e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.523e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.533e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-214ENST00000559258 1047 ntTSL 25.45□□□□□ -1.549e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 NSD1-209ENST00000508896 585 ntTSL 35.34□□□□□ -1.553e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 THADA-203ENST00000402796 2749 ntTSL 55.33□□□□□ -1.563e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.573e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-219ENST00000559751 639 ntTSL 55.2□□□□□ -1.589e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-223ENST00000561171 933 ntTSL 24.51□□□□□ -1.699e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 MORF4L1-206ENST00000558522 1074 ntTSL 24.51□□□□□ -1.699e-8■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EFCAB2-212ENST00000495271 744 ntTSL 54.46□□□□□ -1.73e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 EFCAB2-204ENST00000391837 738 ntTSL 54.29□□□□□ -1.723e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 SDHAF3-203ENST00000479853 774 ntTSL 23.98□□□□□ -1.777e-11■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 THADA-211ENST00000462185 544 ntTSL 53.88□□□□□ -1.793e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.873e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.564e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.467e-7■■■■□ 23.5
ILF3Q12906 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 DDX46-207ENST00000507392 3565 ntTSL 28□□□□□ -1.131e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.241e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 LARP4-212ENST00000548174 584 ntTSL 317.99■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 LARP4-214ENST00000548993 790 ntTSL 516.23■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 LARP4-217ENST00000551886 586 ntTSL 215.19■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 LARP4-213ENST00000548697 587 ntTSL 513.43□□□□□ -0.261e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 LARP4-205ENST00000517559 559 ntTSL 411.25□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 LARP4-211ENST00000523389 588 ntTSL 39.38□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 LARP4-218ENST00000552445 722 ntTSL 37.06□□□□□ -1.281e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 LARP4-216ENST00000550522 567 ntTSL 45.76□□□□□ -1.491e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 LARP4-215ENST00000550260 583 ntTSL 32.98□□□□□ -1.931e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 MED15-226ENST00000478831 707 ntTSL 411.41□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 29.86□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 23.4
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ILF3Q12906 CELF1-210ENST00000526419 476 ntTSL 418.37■□□□□ 0.536e-7■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 CELF1-208ENST00000525841 622 ntTSL 514.66□□□□□ -0.066e-7■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.768e-8■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.678e-8■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 BCL7C-204ENST00000574418 1206 ntTSL 525.46■■□□□ 1.675e-15■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.628e-8■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.235e-15■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 SLC35D2-204ENST00000482643 754 ntTSL 522.67■■□□□ 1.228e-8■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 BCL7C-203ENST00000572628 1603 ntTSL 1 (best)13.7□□□□□ -0.225e-15■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 GLG1-210ENST00000565474 601 ntTSL 44.22□□□□□ -1.732e-6■■■■□ 23.4
ILF3Q12906 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.381e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.441e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 RPS15A-206ENST00000569083 1022 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.621e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 RPS15A-201ENST00000322989 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.681e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 RPS15A-211ENST00000575669 3828 nt7.36□□□□□ -1.231e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 RPS15A-208ENST00000572008 797 ntTSL 56.95□□□□□ -1.31e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 RPS15A-212ENST00000576008 589 ntTSL 1 (best)5.3□□□□□ -1.561e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.571e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 RPS15A-202ENST00000562935 427 ntTSL 25.26□□□□□ -1.571e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 RPS15A-207ENST00000569365 481 ntTSL 34.5□□□□□ -1.691e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 RPS15A-210ENST00000574723 418 ntTSL 33.47□□□□□ -1.851e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 RPS15A-204ENST00000563579 284 ntTSL 32.71□□□□□ -1.981e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 CSAD-206ENST00000424990 565 ntTSL 414.17□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 CSAD-207ENST00000437073 581 ntTSL 413.93□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.213e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 CSAD-204ENST00000379850 2379 ntTSL 512.51□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.593e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 BICRA-202ENST00000594866 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.19■■□□□ 1.145e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.375e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 CTAGE5-216ENST00000556990 568 ntTSL 414.44□□□□□ -0.15e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 CTAGE5-213ENST00000555716 558 ntTSL 46.67□□□□□ -1.345e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 CTAGE5-211ENST00000554392 527 ntTSL 43.96□□□□□ -1.785e-7■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 ACAD10-211ENST00000508303 2334 ntTSL 215.52■□□□□ 0.085e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 ACAD10-206ENST00000504803 1674 ntTSL 513.31□□□□□ -0.285e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 ACAD10-218ENST00000546647 774 ntTSL 512.65□□□□□ -0.385e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 ACAD10-203ENST00000455480 4071 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.855e-6■■■■□ 23.3
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