Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCB1Q12824 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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