Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACSM1Q08AH1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACSM1Q08AH1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACSM1Q08AH1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACSM1Q08AH1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACSM1Q08AH1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACSM1Q08AH1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACSM1Q08AH1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ACSM1Q08AH1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACSM1Q08AH1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACSM1Q08AH1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACSM1Q08AH1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACSM1Q08AH1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACSM1Q08AH1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms