Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DSC1Q08554 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSC1Q08554 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSC1Q08554 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms