Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNK2Q07912 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNK2Q07912 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms