Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN1BQ07699 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms