Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4BQ07343 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4BQ07343 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms