Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms