Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 25.4
FMR1Q06787 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.431e-6■■■■□ 25.4
FMR1Q06787 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 25.4
FMR1Q06787 HOXB3-213ENST00000552000 466 ntTSL 37.34□□□□□ -1.236e-9■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 BCOR-212ENST00000615339 2618 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.337e-7■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 BCOR-211ENST00000490976 3480 ntTSL 29.37□□□□□ -0.917e-7■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.578e-7■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 TUBA1C-203ENST00000548470 1105 ntTSL 214.29□□□□□ -0.128e-7■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 TUBA1C-209ENST00000552448 1800 ntTSL 312.24□□□□□ -0.458e-7■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.58e-7■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.548e-7■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 MCM2-206ENST00000474964 2847 ntTSL 218.93■□□□□ 0.623e-7■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.013e-7■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 MCM4-205ENST00000518680 862 ntTSL 514.85□□□□□ -0.036e-7■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 LTBP4-226ENST00000599724 910 ntTSL 519.89■□□□□ 0.777e-7■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 LTBP4-239ENST00000622565 756 ntTSL 424.67■■□□□ 1.541e-6■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 LTBP4-207ENST00000593463 573 ntTSL 420.1■□□□□ 0.811e-6■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 PRPF8-210ENST00000574217 310 ntTSL 28.06□□□□□ -1.123e-15■■■■□ 25.3
FMR1Q06787 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.057e-7■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.023e-13■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 RPAP1-206ENST00000564934 639 ntTSL 317.98■□□□□ 0.474e-6■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.44e-6■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 EP400-209ENST00000616136 3134 ntTSL 214.51□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 EP400-206ENST00000611118 2403 ntTSL 214.28□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 ADNP2-205ENST00000561195 124 ntTSL 38.95□□□□□ -0.984e-6■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)6.04□□□□□ -1.442e-6■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 STIM1-216ENST00000533343 640 ntTSL 39.76□□□□□ -0.857e-9■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 VARS-223ENST00000474643 885 ntTSL 519.23■□□□□ 0.676e-8■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 ANKHD1-220ENST00000511151 1216 ntTSL 327.62■■■□□ 2.011e-6■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 MOV10-204ENST00000413052 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.188e-7■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 MOV10-203ENST00000369645 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.288e-7■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 MOV10-201ENST00000357443 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.558e-7■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 MOV10-202ENST00000369644 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.718e-7■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 MOV10-217ENST00000496577 4312 ntTSL 29.81□□□□□ -0.848e-7■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 MOV10-206ENST00000468624 4689 ntTSL 59.68□□□□□ -0.868e-7■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 DUS1L-211ENST00000578907 1084 ntTSL 334.72■■■■□ 3.158e-7■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 DUS1L-215ENST00000582529 1212 ntTSL 533.39■■■□□ 2.948e-7■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 DUS1L-207ENST00000578176 937 ntTSL 533.1■■■□□ 2.898e-7■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 DUS1L-206ENST00000577907 648 ntTSL 332.14■■■□□ 2.748e-7■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 25.2
FMR1Q06787 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.191e-7■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 MYBBP1A-203ENST00000570986 982 ntTSL 221.08■□□□□ 0.974e-6■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 UBE2O-204ENST00000587127 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.5□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.151e-26■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 AURKA-207ENST00000395914 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-26■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.751e-26■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 AURKA-201ENST00000312783 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.791e-26■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 AURKA-205ENST00000395911 2145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.821e-26■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.931e-26■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.941e-26■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 DCTN1-225ENST00000497666 479 ntTSL 319.82■□□□□ 0.762e-6■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 MAP4-201ENST00000335271 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.84■□□□□ 0.455e-7■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 MAP4-208ENST00000429422 3724 ntTSL 1 (best)12.65□□□□□ -0.385e-7■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.655e-7■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.211e-8■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-8■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.963e-8■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 CHML-203ENST00000638018 705 ntTSL 333.53■■■□□ 2.963e-8■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.693e-8■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 FBXO18-207ENST00000469009 886 ntTSL 515.64■□□□□ 0.094e-7■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 ATIC-208ENST00000444305 569 ntTSL 419.42■□□□□ 0.73e-9■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.474e-6■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.494e-6■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.544e-6■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.614e-6■■■■□ 25.1
FMR1Q06787 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.775e-7■■■■□ 25
FMR1Q06787 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 25
FMR1Q06787 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 25
FMR1Q06787 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 25
FMR1Q06787 DOCK8-216ENST00000495184 9277 ntTSL 1 (best)8.04□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 25
FMR1Q06787 FBXO18-208ENST00000470089 979 ntTSL 536.66■■■■□ 3.464e-7■■■■□ 25
FMR1Q06787 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.517e-25■■■■□ 25
FMR1Q06787 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.47e-25■■■■□ 25
FMR1Q06787 DCTD-203ENST00000500813 1829 ntTSL 220.48■□□□□ 0.877e-25■■■■□ 25
FMR1Q06787 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.734e-7■■■■□ 25
FMR1Q06787 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.74e-7■■■■□ 25
FMR1Q06787 FBXO18-206ENST00000462507 906 ntTSL 216.5■□□□□ 0.234e-7■■■■□ 25
FMR1Q06787 DCTD-207ENST00000507543 1874 ntTSL 515.96■□□□□ 0.157e-25■■■■□ 25
FMR1Q06787 FBXO18-202ENST00000379999 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.534e-7■■■■□ 25
FMR1Q06787 CCAR2-205ENST00000520738 2633 ntTSL 218.18■□□□□ 0.53e-6■■■■□ 25
FMR1Q06787 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 25
FMR1Q06787 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 25
FMR1Q06787 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.173e-6■■■■□ 25
FMR1Q06787 HUWE1-207ENST00000468322 729 ntTSL 212.62□□□□□ -0.397e-7■■■■□ 25
FMR1Q06787 ABL1-203ENST00000393293 532 ntTSL 59.08□□□□□ -0.968e-10■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 01e-6■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 01e-6■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.077e-8■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.77e-8■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 BRD4-208ENST00000597315 892 ntTSL 533.48■■■□□ 2.955e-12■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.855e-12■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.132e-8■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 ISYNA1-214ENST00000583816 860 ntTSL 318.48■□□□□ 0.552e-8■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 EIF4G1-226ENST00000450424 2658 ntTSL 520.73■□□□□ 0.912e-7■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 EIF4G1-210ENST00000421110 2755 ntTSL 518.87■□□□□ 0.612e-7■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 MARS-220ENST00000549827 465 ntTSL 215.37■□□□□ 0.053e-7■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 RRM1-204ENST00000526865 562 ntTSL 45.73□□□□□ -1.496e-7■■■■□ 24.9
FMR1Q06787 MCM2-209ENST00000491422 2844 ntTSL 515.67■□□□□ 0.14e-7■■■■□ 24.9
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 66.4 ms