Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTF1Q05048 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms