Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ERCC6Q03468 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ERCC6Q03468 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms