Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPCQ03188 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms