Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC3AQ02505 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms