Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC2Q02487 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms