Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms