Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSF1Q00613 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms