Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSBP2P81877 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP2P81877 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms