Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2P78314 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
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