Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNC1P63316 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms