Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL30P62888 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL30P62888 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL30P62888 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL30P62888 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL30P62888 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL30P62888 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL30P62888 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL30P62888 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL30P62888 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL30P62888 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL30P62888 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL30P62888 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL30P62888 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL30P62888 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL30P62888 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL30P62888 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL30P62888 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL30P62888 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL30P62888 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL30P62888 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL30P62888 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL30P62888 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL30P62888 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL30P62888 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL30P62888 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms