Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVS71-1P61550 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms