Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHBDL3P58872 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms