Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXL3P58215 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms