Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB25P57735 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB25P57735 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB25P57735 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB25P57735 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB25P57735 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB25P57735 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB25P57735 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB25P57735 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB25P57735 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB25P57735 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB25P57735 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB25P57735 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB25P57735 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB25P57735 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB25P57735 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB25P57735 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB25P57735 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB25P57735 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB25P57735 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB25P57735 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB25P57735 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB25P57735 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB25P57735 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB25P57735 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB25P57735 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB25P57735 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB25P57735 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB25P57735 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB25P57735 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB25P57735 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB25P57735 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB25P57735 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB25P57735 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB25P57735 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB25P57735 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB25P57735 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB25P57735 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB25P57735 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB25P57735 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms