Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX4P57082 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBX4P57082 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX4P57082 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX4P57082 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX4P57082 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX4P57082 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX4P57082 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX4P57082 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX4P57082 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX4P57082 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBX4P57082 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX4P57082 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX4P57082 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX4P57082 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX4P57082 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX4P57082 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX4P57082 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX4P57082 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBX4P57082 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX4P57082 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX4P57082 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX4P57082 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX4P57082 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX4P57082 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX4P57082 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX4P57082 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBX4P57082 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX4P57082 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX4P57082 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX4P57082 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX4P57082 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX4P57082 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX4P57082 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX4P57082 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX4P57082 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX4P57082 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX4P57082 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBX4P57082 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX4P57082 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX4P57082 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX4P57082 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX4P57082 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX4P57082 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX4P57082 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX4P57082 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX4P57082 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX4P57082 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX4P57082 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX4P57082 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBX4P57082 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBX4P57082 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBX4P57082 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX4P57082 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX4P57082 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX4P57082 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX4P57082 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX4P57082 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX4P57082 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX4P57082 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX4P57082 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX4P57082 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX4P57082 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBX4P57082 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TBX4P57082 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX4P57082 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX4P57082 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX4P57082 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX4P57082 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX4P57082 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX4P57082 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX4P57082 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX4P57082 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX4P57082 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms