Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY3P57055 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY3P57055 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY3P57055 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY3P57055 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY3P57055 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY3P57055 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY3P57055 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY3P57055 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY3P57055 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY3P57055 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY3P57055 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY3P57055 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms