Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSWP56202 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTSWP56202 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTSWP56202 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTSWP56202 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTSWP56202 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTSWP56202 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTSWP56202 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTSWP56202 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTSWP56202 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTSWP56202 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSWP56202 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSWP56202 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSWP56202 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSWP56202 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSWP56202 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSWP56202 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSWP56202 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSWP56202 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSWP56202 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSWP56202 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSWP56202 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSWP56202 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTSWP56202 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTSWP56202 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTSWP56202 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTSWP56202 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CTSWP56202 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTSWP56202 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTSWP56202 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTSWP56202 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CTSWP56202 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTSWP56202 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTSWP56202 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTSWP56202 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTSWP56202 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTSWP56202 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTSWP56202 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CTSWP56202 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTSWP56202 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTSWP56202 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTSWP56202 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTSWP56202 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTSWP56202 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTSWP56202 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTSWP56202 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTSWP56202 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTSWP56202 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTSWP56202 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTSWP56202 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTSWP56202 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTSWP56202 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTSWP56202 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTSWP56202 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTSWP56202 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTSWP56202 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CTSWP56202 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTSWP56202 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CTSWP56202 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTSWP56202 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTSWP56202 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTSWP56202 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CTSWP56202 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTSWP56202 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTSWP56202 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTSWP56202 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTSWP56202 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTSWP56202 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTSWP56202 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTSWP56202 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTSWP56202 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTSWP56202 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTSWP56202 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTSWP56202 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTSWP56202 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTSWP56202 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTSWP56202 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTSWP56202 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTSWP56202 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTSWP56202 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTSWP56202 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTSWP56202 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTSWP56202 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTSWP56202 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTSWP56202 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms