Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA1P56199 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA1P56199 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ITGA1P56199 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA1P56199 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA1P56199 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA1P56199 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA1P56199 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA1P56199 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA1P56199 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA1P56199 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA1P56199 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGA1P56199 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA1P56199 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA1P56199 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA1P56199 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA1P56199 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA1P56199 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA1P56199 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms