Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRISP3P54108 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRISP3P54108 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms