Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2KP53803 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.3 ms