Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 SS18L1-203ENST00000450482 781 ntTSL 518.83■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 PITPNM2-204ENST00000451868 1639 ntTSL 1 (best)22.83■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 29.4
HNRNPMP52272 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.342e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 516.42■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.582e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 AC007388.1-208ENST00000438649 1901 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 AC007388.1-209ENST00000425775 527 ntTSL 412.04□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 AC007388.1-211ENST00000451547 329 ntTSL 53.11□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)31.94■■■□□ 2.77e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 FRYL-203ENST00000502520 441 ntTSL 229.17■■■□□ 2.269e-9■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 FRYL-219ENST00000515684 465 ntTSL 327.21■■□□□ 1.959e-9■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 FRYL-218ENST00000514783 2031 ntTSL 1 (best)20.3■□□□□ 0.849e-9■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.889e-9■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.079e-9■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 FRYL-212ENST00000509886 692 ntTSL 1 (best)6.19□□□□□ -1.429e-9■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 FRYL-207ENST00000505437 443 ntTSL 33.5□□□□□ -1.859e-9■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 RBM33-208ENST00000438356 547 ntTSL 419.05■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.056e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.486e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 LMBR1-210ENST00000434503 930 ntTSL 533.48■■■□□ 2.951e-6■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 LMBR1-213ENST00000454132 2922 ntTSL 225.7■■□□□ 1.711e-6■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 LMBR1-204ENST00000415428 3457 ntTSL 1 (best)10.38□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 POLD2-214ENST00000481104 541 ntTSL 234.15■■■■□ 3.061e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 POLD2-211ENST00000464871 580 ntTSL 330.48■■■□□ 2.471e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 PHF14-206ENST00000476009 1044 ntTSL 329.84■■■□□ 2.371e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.231e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 MICAL3-205ENST00000424046 542 ntTSL 427.72■■■□□ 2.039e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.871e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 PHF14-210ENST00000490957 4058 ntTSL 519.31■□□□□ 0.681e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 KCNMB2-AS1-202ENST00000425330 508 ntTSL 317.84■□□□□ 0.456e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 RNF123-210ENST00000487805 5882 ntTSL 217.14■□□□□ 0.341e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 RNF123-209ENST00000486102 4564 ntTSL 1 (best)15.89■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 KCNMB2-AS1-204ENST00000437488 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.036e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 RNF123-201ENST00000327697 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 RNF123-207ENST00000457726 4506 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC11.99□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC8.12□□□□□ -1.116e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 SKIV2L2-207ENST00000506750 3271 ntTSL 25.54□□□□□ -1.521e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 KCNMB2-AS1-203ENST00000432385 516 ntTSL 33.87□□□□□ -1.796e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 KCNMB2-AS1-201ENST00000421498 393 ntTSL 33.87□□□□□ -1.796e-8■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 519.1■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 29.3
HNRNPMP52272 CD46P1-201ENST00000441364 763 ntBASIC15.12■□□□□ 0.012e-10■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CR1L-203ENST00000508064 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-10■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CR1L-205ENST00000531844 663 ntTSL 212.88□□□□□ -0.352e-10■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 TNRC6A-209ENST00000562829 277 ntTSL 226.82■■□□□ 1.883e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.717e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-234ENST00000492871 1065 ntTSL 340.86■■■■■ 4.132e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-215ENST00000462807 628 ntTSL 240.8■■■■■ 4.122e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-235ENST00000493138 694 ntTSL 339.82■■■■□ 3.972e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 339.82■■■■□ 3.972e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.792e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.322e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.122e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-213ENST00000453943 656 ntTSL 1 (best)33.94■■■■□ 3.022e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.822e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.812e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-236ENST00000493209 735 ntTSL 531.25■■■□□ 2.592e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.42e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-230ENST00000485838 774 ntTSL 329.47■■■□□ 2.312e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.732e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 524.57■■□□□ 1.522e-9■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 523.93■■□□□ 1.422e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.382e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-226ENST00000484953 273 ntTSL 221.5■■□□□ 1.032e-9■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 521.48■■□□□ 1.032e-9■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 321.34■■□□□ 1.012e-9■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-233ENST00000491613 959 ntTSL 321.29■■□□□ 12e-9■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 319.89■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 319.19■□□□□ 0.662e-9■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 AK4-205ENST00000479060 867 ntTSL 314.35□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 TTC3-215ENST00000476784 7425 ntTSL 28.23□□□□□ -1.095e-8■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 SPDYA-205ENST00000462832 2081 ntTSL 26.56□□□□□ -1.367e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 WDR4-204ENST00000470658 901 ntTSL 532.61■■■□□ 2.812e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 RGS12-217ENST00000510803 480 ntTSL 230.39■■■□□ 2.462e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.892e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 VPS26A-207ENST00000490696 800 ntTSL 524.16■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 RGS12-223ENST00000513991 2172 ntTSL 223.91■■□□□ 1.422e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 POLR1C-207ENST00000481352 1725 ntTSL 523.61■■□□□ 1.372e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 RGS12-225ENST00000515521 796 ntTSL 523.42■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.282e-7■■■■■ 29.2
HNRNPMP52272 CASP8-218ENST00000471383 969 ntTSL 1 (best)22.64■■□□□ 1.212e-7■■■■■ 29.2
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 472.5 ms