Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR3P51677 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR3P51677 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR3P51677 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR3P51677 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR3P51677 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR3P51677 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR3P51677 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR3P51677 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR3P51677 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR3P51677 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR3P51677 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR3P51677 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR3P51677 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR3P51677 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR3P51677 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR3P51677 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR3P51677 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR3P51677 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR3P51677 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR3P51677 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR3P51677 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR3P51677 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCR3P51677 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCR3P51677 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCR3P51677 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCR3P51677 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR3P51677 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR3P51677 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms