Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRCA2P51587 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms