Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPOLAP51003 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAPOLAP51003 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms