Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPFP49454 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPFP49454 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPFP49454 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPFP49454 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPFP49454 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPFP49454 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPFP49454 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPFP49454 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPFP49454 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPFP49454 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPFP49454 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPFP49454 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPFP49454 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPFP49454 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPFP49454 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPFP49454 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPFP49454 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPFP49454 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPFP49454 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPFP49454 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPFP49454 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPFP49454 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPFP49454 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPFP49454 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPFP49454 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPFP49454 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPFP49454 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPFP49454 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPFP49454 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPFP49454 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPFP49454 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPFP49454 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPFP49454 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPFP49454 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPFP49454 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPFP49454 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPFP49454 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPFP49454 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPFP49454 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPFP49454 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPFP49454 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPFP49454 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPFP49454 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPFP49454 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPFP49454 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPFP49454 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPFP49454 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPFP49454 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPFP49454 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPFP49454 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPFP49454 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPFP49454 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPFP49454 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPFP49454 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPFP49454 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPFP49454 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPFP49454 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPFP49454 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPFP49454 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPFP49454 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPFP49454 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPFP49454 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPFP49454 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPFP49454 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPFP49454 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPFP49454 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPFP49454 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPFP49454 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms