Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMTP48728 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMTP48728 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMTP48728 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMTP48728 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMTP48728 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMTP48728 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms