Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMUP48645 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NMUP48645 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMUP48645 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMUP48645 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMUP48645 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMUP48645 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMUP48645 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMUP48645 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMUP48645 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMUP48645 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMUP48645 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NMUP48645 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NMUP48645 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMUP48645 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMUP48645 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMUP48645 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMUP48645 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMUP48645 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMUP48645 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMUP48645 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMUP48645 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMUP48645 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMUP48645 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMUP48645 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMUP48645 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMUP48645 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms