Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms