Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSBP45954 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACADSBP45954 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms