Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCAMP43121 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCAMP43121 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCAMP43121 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCAMP43121 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCAMP43121 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MCAMP43121 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCAMP43121 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCAMP43121 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCAMP43121 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCAMP43121 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCAMP43121 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCAMP43121 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCAMP43121 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCAMP43121 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCAMP43121 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCAMP43121 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCAMP43121 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCAMP43121 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCAMP43121 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCAMP43121 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCAMP43121 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MCAMP43121 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCAMP43121 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCAMP43121 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCAMP43121 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCAMP43121 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCAMP43121 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCAMP43121 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCAMP43121 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCAMP43121 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCAMP43121 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCAMP43121 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCAMP43121 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCAMP43121 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCAMP43121 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCAMP43121 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCAMP43121 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCAMP43121 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCAMP43121 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCAMP43121 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MCAMP43121 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MCAMP43121 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCAMP43121 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCAMP43121 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCAMP43121 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCAMP43121 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCAMP43121 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCAMP43121 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCAMP43121 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCAMP43121 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCAMP43121 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCAMP43121 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCAMP43121 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCAMP43121 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCAMP43121 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCAMP43121 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCAMP43121 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms