Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC5P40937 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC5P40937 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC5P40937 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC5P40937 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC5P40937 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC5P40937 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC5P40937 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC5P40937 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC5P40937 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC5P40937 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC5P40937 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC5P40937 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC5P40937 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC5P40937 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC5P40937 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC5P40937 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC5P40937 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC5P40937 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC5P40937 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC5P40937 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC5P40937 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC5P40937 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC5P40937 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC5P40937 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC5P40937 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC5P40937 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC5P40937 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC5P40937 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC5P40937 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC5P40937 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC5P40937 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC5P40937 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC5P40937 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC5P40937 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC5P40937 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC5P40937 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC5P40937 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC5P40937 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC5P40937 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC5P40937 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC5P40937 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC5P40937 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC5P40937 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC5P40937 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC5P40937 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC5P40937 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC5P40937 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC5P40937 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC5P40937 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC5P40937 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC5P40937 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC5P40937 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC5P40937 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC5P40937 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC5P40937 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC5P40937 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC5P40937 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC5P40937 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC5P40937 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC5P40937 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC5P40937 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC5P40937 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC5P40937 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC5P40937 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC5P40937 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC5P40937 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC5P40937 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC5P40937 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC5P40937 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC5P40937 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC5P40937 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC5P40937 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC5P40937 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms