Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP8P40818 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP8P40818 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP8P40818 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP8P40818 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP8P40818 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP8P40818 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP8P40818 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP8P40818 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP8P40818 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP8P40818 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP8P40818 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP8P40818 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP8P40818 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP8P40818 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP8P40818 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP8P40818 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP8P40818 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP8P40818 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP8P40818 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP8P40818 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP8P40818 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP8P40818 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP8P40818 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP8P40818 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP8P40818 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP8P40818 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP8P40818 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP8P40818 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP8P40818 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP8P40818 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP8P40818 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP8P40818 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP8P40818 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP8P40818 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP8P40818 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP8P40818 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP8P40818 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP8P40818 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP8P40818 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP8P40818 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP8P40818 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP8P40818 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP8P40818 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP8P40818 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP8P40818 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP8P40818 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP8P40818 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP8P40818 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP8P40818 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP8P40818 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP8P40818 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP8P40818 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP8P40818 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP8P40818 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP8P40818 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP8P40818 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms