Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms