Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKAP35790 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKAP35790 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKAP35790 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKAP35790 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKAP35790 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKAP35790 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKAP35790 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKAP35790 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKAP35790 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKAP35790 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKAP35790 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKAP35790 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKAP35790 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKAP35790 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKAP35790 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKAP35790 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKAP35790 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKAP35790 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKAP35790 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKAP35790 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKAP35790 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKAP35790 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKAP35790 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKAP35790 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKAP35790 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKAP35790 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKAP35790 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKAP35790 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKAP35790 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKAP35790 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKAP35790 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKAP35790 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKAP35790 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKAP35790 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKAP35790 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKAP35790 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKAP35790 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKAP35790 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKAP35790 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKAP35790 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKAP35790 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKAP35790 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKAP35790 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKAP35790 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKAP35790 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKAP35790 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKAP35790 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKAP35790 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKAP35790 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKAP35790 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKAP35790 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKAP35790 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKAP35790 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKAP35790 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKAP35790 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKAP35790 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKAP35790 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKAP35790 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms