Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK1P35558 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK1P35558 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK1P35558 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK1P35558 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK1P35558 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK1P35558 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK1P35558 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK1P35558 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK1P35558 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK1P35558 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK1P35558 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK1P35558 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK1P35558 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK1P35558 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK1P35558 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK1P35558 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK1P35558 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK1P35558 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK1P35558 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK1P35558 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK1P35558 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK1P35558 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK1P35558 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK1P35558 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK1P35558 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK1P35558 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK1P35558 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK1P35558 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK1P35558 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK1P35558 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK1P35558 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK1P35558 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK1P35558 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK1P35558 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK1P35558 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK1P35558 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK1P35558 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK1P35558 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK1P35558 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK1P35558 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK1P35558 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK1P35558 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK1P35558 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK1P35558 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCK1P35558 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCK1P35558 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PCK1P35558 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCK1P35558 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCK1P35558 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCK1P35558 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK1P35558 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCK1P35558 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCK1P35558 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms